只有依据经络、腧穴理论，结合临床具体实践，才能合理地选取适当的腧穴，为正确拟定针灸处方打下基础。针灸处方中腧穴的选择，是以阴阳、脏腑、经络和气血等学说为依据的，其基本原则是“循经取穴”，这是根据“经脉所通，主治所及”的原理而来的。因此，在“循经取穴”的指导下，取穴原则可包括近部取穴、远部取穴和随证取穴。
近部取穴：近部取穴是指在病痛的局部和邻近的选取腧穴，它是以腧穴近治作用为依据的。其应用非常广泛，大凡其症状在体表部位反映较为明显和较为局限的病证，均可按近部取穴原则选取腧穴，予以治疗。例如，眼病取睛明、球后、攒竹、风池等，鼻病取迎香、巨，面瘫取颊车、地仓，胃痛取中脘等，皆属于近部取穴。
远部取穴：远部取穴在距离病痛较远的部位选取腧穴，它是以腧穴的远治作用为依据的。这是针灸处方选穴的基本方法，体现了针灸辨证论治的思想。远部取穴运用非常广泛，临床上多选择肘膝以下的穴位进行治疗，在具体应用时，既可取所病脏腑经脉的本经腧穴（本经取穴），也可取与病变脏腑经脉相表里的经脉上的腧穴（表里经取穴）或名称相同的经脉上的腧穴（同名经取穴）进行治疗。例如，咳嗽、咳血为肺系病证，可选取手太阴肺经的尺泽、鱼际、太渊（本经取穴），也可选择与足太阴脾经的太白（同名经取穴）；胃脘疼痛属胃的病证，可选取足阳明胃经的足三里，同时可选足太阴脾经的公孙（表里经），面部疾患选取合谷，目赤肿痛取行间，久痢脱肛取百会，急性腰扭伤取水沟等，均为远部取穴的具体应用。
随证取穴：随证取穴，亦名对证取穴，或辨证取穴，是指针对某些全身症状或疾病的病因病机而选取腧穴，这一取穴原则根据中医理论和和腧穴主治功能而提出的。因在临床上有许多病证，如，如发热、失眠、多梦、自汗、盗汗、虚脱、抽风、昏迷等全身性疾病，往往难以辨位，不适合用上述取穴方法，此时就必须根据病证的性质，进行辨证分析，将病证归属于某一脏腑和经脉，再按照随证取穴的原则选取适当的腧穴进行治疗。如因心肾不交的失眠，辨证归心、肾两经，故取心、肾经神门、太溪等腧穴。
对于各别突出的症状，也可以结合临床经验而选穴。如，发热者可取大椎、曲池，痰多者取丰隆等，也可归于随证取穴的范畴。
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