影响所有绝经期综合症的女性共同因素是激素水平下降。由于卵巢萎缩，使雌激素水平和孕酮水平不断下降。对处于自然状态的绝经后妇女来说，她们的雌激素不再由卵巢产生，而是在外周由雄激素转化而来，而雄激素又是卵巢的基质细胞（不是滤泡）和肾上腺所产生的。可以想象，这时体内雌激素水平比绝经前要低多了。
与能在任何年龄下对性活动动施加各种影响的心理的或社会的因素有所不同，雌激素的严重匮乏将对绝经期妇女的性表现产生特定的影响。人们早在４０多年前就认识到雌激素丧失与性功能障碍的关系，当初介绍使用雌激素替代疗法的原因之一，就是要设法保持性功能的正常进行。专家把没有接受替代疗法的绝经期妇女看作是"去掉性别的人"。
雌激素水平下降给这一时期女性生殖器造成了种种变化。阴阜和会阴部的脂肪消失，阴唇逐渐萎缩几乎消失，阴毛和腋毛日趋稀疏。卵巢显著萎缩，输卵管细若线绳，子宫恢复到青春期前大小，子宫内膜和子宫颈同样出现萎缩。阴道失去弹性和扩张能力，变得又短又脆弱，阴道上皮变薄和发白，有时因失去对血管的保护性支持而容易发生出血，此外阴道润滑物的分泌速率和分泌量减少。
这些生理方面的变化，特别是阴唇脂肪的消失和阴道上皮的萎缩性变化会导致８－３０％的绝经后妇女出现性交疼痛。
、性兴趣的降低似乎与雌激素的减退相关联。有人比较了同一年龄组中分别处于绝经前、绝经中、绝经后的妇女，调查结果发现她们分别有５２％、６８％和７９％的人报告性兴趣的降低。
、性生活频率也随着雌激素的减退而减少。一项调查表明，比绝经晚期血雌激素水平高一倍的绝经早期妇女，其性交频率也差不多高一倍。虽然许多行家认为睾酮水平是性的驱动力，但这两组妇女之间的睾酮水平却没有差别。有人认为当血雌激素水平低到３５毫微克/毫克或更低时，将预示着性交频率的明显变化（少于每周１次），因此这一数值成了一个关键性数字。当雌激素水平高于此值时，几乎所有的妇女每周至少性交一次。有一项调查表明，４６－５０岁、５０－６０岁、６０－７０岁三个年龄组中停止性活动的妇妇人数分别占１４％、４２％和７３％。调查还表明绝经后妇女的所有形式的性活动频率（性交、手对生殖器的刺激和肉体亲昵活动等）都低于绝经期前的妇女。
3、性高潮能力在绝经后也有下降。虽然多数人的高潮能力仍然保持不变，但据报道在３８岁、５０岁、５４岁三个年龄组中分别有１２％、１６％和２４％的妇女报告在性交时无法达到性高潮。
绝经期综合症女性经历的性反应周期的其他变化包括：
性红晕发生率下降，肌紧张度降低，性刺激时乳房体积不再增大，前庭大腺分泌变慢或停止，阴道润滑延迟或缺失，阴道经宫颈横断面处的宽度减小，阴道外１/３充血程度减轻，高潮时较少或偶尔出现子宫痛性收缩。
毫不奇怪，绝经后妇女的整个性反应变得迟钝或削弱了。
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